TLR9 ve Irak4 genlerindeki sekans varyantların akciğer kanseri riski ile ilişkisinin belirlenmesi
Tezin Türü: Yüksek Lisans
Tezin Yürütüldüğü Kurum: Kütahya Sağlık Bilimleri Üniversitesi, Lisansüstü Eğitim Enstitüsü, TIBBİ BİYOLOJİ ANABİLİM DALI, Türkiye
Tezin Onay Tarihi: 2023
Tezin Dili: Türkçe
Öğrenci: TUĞÇE GÜL GÜNEY
Danışman: Cansu Özbayer
Açık Arşiv Koleksiyonu: AVESİS Açık Erişim Koleksiyonu
Özet:Akciğer kanseri en sık gözlenen kanser türü olup her dört kanserden biri akciğer kanseri olarak tanı alır. Bu nedenle akciğer kanseri, erken teşhis ve zamanında müdahalenin kritik olduğu kanserler arasındadır. İnsan akciğer kanserleri, küçük hücreli akciğer karsinomu (SCLC) ve küçük hücreli olmayan akciğer karsinomu (NSCLC) olarak sınıflandırılır ve NSCLC daha yaygın olup akciğer kanser türlerinin %85'ini oluşturur. Toll like reseptörler (TLR'ler),enfeksiyonlara karşı doğal immün cevabın oluşmasını sağlayan hücre yüzeyinde ve endositik bölmelerde eksprese edilen bir grup transmembran proteinidir. Günümüzde spesifik ligandlara sahip 13 memeli TLR'si(TLR1–13) tanımlanmıştır. İnsanlarda 10 tanesi (TLR1–10) eksprese olur. TLR3, 7 ve 8 viral kaynaklı RNA'ları; TLR1, 2 ve 6, bakteriyel lipoproteinleri TLR4 lipopolisakkaritleri ve TLR5 flagellinleri tanır. TLR9, bakteri ve virüslerde bulunan metillenmemiş CpG motiflerini tanır ve tip I interferonlar (IFN'ler) gibi antiviral sitokinlerin üretimini tetikleyerek antiviral tepkileri başlatır. Bazı otoimmün hastalıkların ve çeşitli enfeksiyonlar, kanserler (meme, beyin, mide, akciğer ve prostat kanseri ) TLR9 aktivasyonu ve ekspresyonu ile ilişkilidir. Akciğer kanser dokularındaki tümör hücrelerinde ve hücre hatlarında güçlü TLR9 protein ekspresyonu gözlenirken normal akciğer dokularında TLR9'un zayıf ekspresyonu gözlenmiştir. TLR9'un aktivasyonu, bir dizi doğal ve adaptif bağışıklık tepkisini başlatır.Bağışıklık aktivasyonunu başlatmak için doğrudan TLR9 proteini ile TLR9'un en önemli ikinci habercisi miyeloid farklılaşma birincil yanıt geni 88 ( MyD88 ) etkileşime girer. IRAK 4, IL-1R ilişkili kinaz ailesine ait olup, MyD88 bağımlı yolakta görev alarak TLR ile düzenlenen sinyalizasyonunu düzenler. Çalışmamızda 90 akciğer kanseri(NSCLC) hastası ve 90 kontrol bireyden izole edilecek genomik DNA'lar TLR9, IRAK4 gen promotörlerindeki varyasyonlar için SANGER sekanslama yöntemi ile dizilenecektir. TLR9 ve IRAK4 serum seviyeleri ELİSA yöntemi ile ticari kitler kullanılarak belirlenecektir. Sonuçlar uygun istatistiksel yöntemler ile değerlendirilecek ve 0.05'den küçük olan p değeri anlamlı kabul edilecektir. Sonuçlarımızın akciğer kanseri ve TLR ile ilgili literatüre önemli bir veri sağlayacağı ve teşhis ve tedavi çalışmaları için önemli bir moleküler yaklaşım kazandırabileceği öngörülmektedir