CXCR6 ve CXCL16 genlerindeki sekans varyantların akciğer kanseri riski ile ilişkisinin belirlenmesi


Tezin Türü: Yüksek Lisans

Tezin Yürütüldüğü Kurum: Kütahya Sağlık Bilimleri Üniversitesi, Lisansüstü Eğitim Enstitüsü, TIBBİ BİYOLOJİ ANABİLİM DALI, Türkiye

Tezin Onay Tarihi: 2023

Tezin Dili: Türkçe

Öğrenci: ALEYNA ÇALIŞKAN

Danışman: Cansu Özbayer

Açık Arşiv Koleksiyonu: AVESİS Açık Erişim Koleksiyonu

Özet:

Akciğer kanseri, inflamasyon ve kemokin arasındaki ilişkinin belirlenmesi ve yeni biyobelirteçlerin tanımlanmasını sağlamak amacıyla CXCL16 ve CXCR6 genleri aday genler olarak belirlenmiştir. Bu doğrultuda CXCL16 ve CXCR6 gen varyantları ve serum seviyelerinin akciğer kanseri riski ile olan ilişkisini belirlemek amaçlanmıştır. Kütahya Sağlık Bilimleri Üniversitesi Evliya Çelebi Eğitim ve Araştırma Hastanesi Göğüs Hastalıkları polikliniğine başvuran 45 sağlıklı kontrol birey ve 45 akciğer kanserli hasta birey çalışmamıza dahil edilmiştir. Çalışmaya katılan bireylerden toplanan periferik kandan DNA izolasyonu yapılmıştır. CXCL16 ve CXCR6 gen bölgeleri PCR ile amplifiye edilmiş ve Sanger sekans yöntemi ile genotiplendirilmiştir. Serum CXCL16 ve CXCR6 seviyeleri ise ELISA yöntemi ile ölçülmüştür. Veriler uygun istatistiksel analiz yöntemlerine göre değerlendirilmiştir. Bulgular: Yapılan çalışmalar sonucu, CXCL16 geninde 6244. pozisyon T/G değişimi, 6803. pozisyon N değişimi, 6781. pozisyon A/T ve A/N değişimi, 6793. pozisyon C/T değişimi, 6796. pozisyon G alel yerine delesyon oluşumu ve aynı pozisyonda G/C değişimi, 6800.pozisyon C/T değişimi, 6807. ve 6811. pozisyon G alel yerine delesyon varlığı kontrol ve hasta grubu bireylerde istatistiksel olarak anlamlı saptanmıştır. CXCR6 geninde ise 4926. pozisyon A alel yerine delesyon oluşumu, 4921. pozisyon G/C ve G/A değişimi, 4922. pozisyon C/A değişimi, 4938. Pozisyon dupC ve 5576. pozisyon dupT oluşumu gruplar arasında istatiksel olarak anlamlı bulunmuştur. Kontrol ve akciğer kanserli hastaların serum CXCL16 seviyeleri karşılaştırıldığında kontrol ve hasta bireyler arasında fark bulunmamıştır (p< 0,05). CXCR6 serum seviyeleri ise akciğer kanserli hastalarda kontrol bireylere göre anlamlı oranda yüksek bulunmuştur. Değişimlerin kontrol ve hasta grupları arasında farklılık göstermesi ve bazı değişimlerin sadece kontrol veya hasta grubunda saptanması CXCL16 ve CXCR6 gen varyantlarının akciğer kanseri riski ile ilişkili olabileceğini göstermiştir. CXC16 ve CXCR6 serum seviyelerine bakıldığında ise sadece CXCR6 serum seviyesinin akciğer kanseri hasta grubunda anlamlı olduğu saptanmıştır. Bu sonuçlar, akciğer kanseri riski ile CXCR6 serum seviyesi ilişkisini göstermiştir.